Kho lưu trữ mô người & phân tích mô

Tài nguyên chung Kho lưu trữ và Phân tích Mô người (HTR-TA) được hỗ trợ và quản lý chung bởi Trung tâm Ung thư Toàn diện UNM và Khoa Giải phẫu bệnh. Tài nguyên chung HTR-TA là được chứng nhận bởi Trường Cao đẳng Bệnh học Hoa Kỳ (CAP).

Nguồn tài nguyên chung HTR-TA được thiết lập để hỗ trợ nghiên cứu chuyển dịch của các giảng viên tại Trung tâm Ung thư UNM, Khoa Bệnh học, Trường Y và các Viện khác. Trang web này mô tả các dịch vụ được cung cấp và thông tin liên hệ của các nhân viên nguồn tài nguyên chung HTR-TA, những người có thể tư vấn về tình trạng sẵn có của mẫu vật và tất cả các khía cạnh của mô học và bệnh học phân tử.

Mục đích

Tài nguyên chia sẻ Kho lưu trữ mô người và phân tích mô (HTR-TA) hỗ trợ nghiên cứu ung thư cơ bản và chuyển dịch bằng cách cung cấp mô khối u và mô bình thường phù hợp dưới dạng mẫu đông lạnh hoặc cố định bằng formalin, nhúng parafin (FFPE) cho người dùng.

Về tài nguyên chia sẻ HTR-TA

Tài nguyên chung HTR-TA:

  • Mang lại lợi ích cho bệnh nhân trong tương lai bằng cách cho phép các nhà nghiên cứu tiếp cận với các mô được bảo quản và duy trì tốt mà có thể không có sẵn
  • Mang lại lợi ích cho UNM HSC bằng cách tăng cường sứ mệnh cung cấp dịch vụ chăm sóc bệnh nhân chất lượng thông qua thúc đẩy nghiên cứu sáng tạo và có giá trị lâm sàng
  • Chức năng môi giới trung thực của nguồn tài nguyên được chia sẻ HTR-TA trong việc phân phối các mẫu vật không xác định danh tính không có 18 mã định danh cá nhân HIPAA bảo vệ các nhà nghiên cứu khỏi các biến chứng/vi phạm HIPAA tiềm ẩn

Tài nguyên chia sẻ HTR-TA cung cấp một số thông tin thiết yếu dịch vụ mô học, Bao gồm:

  • xử lý mô và nhúng parafin,
  • phân đoạn,
  • nhuộm H&E,
  • immunhistochemical và hình ảnh kỹ thuật số, và
  • phân tích các phần nhuộm màu ngoài việc lưu trữ và giải phóng các mẫu mô.

Mô được thu thập khi có sự đồng ý phù hợp. Chúng được lưu trữ trong một cơ sở dữ liệu cũng chứa thông tin liên kết về bệnh nhân (ví dụ: tên, ngày sinh và các nhóm nhân khẩu học tự xác định), nguồn gốc và chẩn đoán mô, cùng các biến số khác bao gồm phương pháp thu thập mô, thời gian thiếu máu cục bộ và cách xử lý mô sau khi được HTR-TA tiếp nhận.

Hiện tại, HTR-TA lưu giữ hơn 60,000 mẫu sinh học, trong đó có hơn 20,000 mẫu đông lạnh và hơn 17,000 mẫu FFPE cùng hơn 7,000 mẫu máu (máu toàn phần, huyết thanh, huyết tương và cả tế bào đông lạnh và bảo quản lạnh).

Bộ sưu tập mô HTR-TA phản ánh các quần thể trong khu vực lưu vực UNMCCC.

Tóm tắt về các dịch vụ tài nguyên chung của HTR-TA dành cho các đơn xin tài trợ

Nguồn tài nguyên chung về Kho lưu trữ mô người và Phân tích mô (HTR-TA) có khả năng thực hiện một số kỹ thuật và cung cấp nhiều dịch vụ khác nhau theo hình thức tính phí cho mỗi dịch vụ.

Nguồn tài nguyên chung HTR-TA thu thập mô bình thường và mô khối u phù hợp chủ yếu từ các mẫu phẫu thuật còn sót lại và lưu trữ chúng ở dạng đông lạnh hoặc dưới dạng khối nhúng parafin cố định bằng formalin (FFPE). Các nhà nghiên cứu có thể yêu cầu các mô, với sự chấp thuận bắt buộc từ IRB (Văn phòng bảo vệ nghiên cứu của con người) và Ủy ban đánh giá khoa học (SRC).

Nguồn tài nguyên chia sẻ HTR-TA cũng có thể cung cấp một số dịch vụ mô học và phân tử khác nhau, chẳng hạn như cắt lát và nhuộm H&E, miễn dịch mô hóa học và miễn dịch huỳnh quang bằng cách sử dụng Nền tảng Ventana Discovery Ultra, tạo Mảng mô tùy chỉnh (TMA), số hóa tiêu bản (trường sáng) thông qua Aperio AT2 và phân tích hình ảnh bằng Nền tảng HALO™ (từ Indica Labs, trụ sở chính tại Albuquerque, NM).

Có nhiều kiểu xử lý máu khác nhau, bao gồm cả hiệu suất đếm tế bào và khả năng sống sót thông qua Nexelom Cellometer 1000.

Một số nhà nghiên cứu yêu cầu mẫu vật được chuẩn bị đặc biệt hoặc có yêu cầu cụ thể về mẫu vật. Đối với các nghiên cứu được chấp thuận này, nhân viên nguồn lực chung của HTR-TA sẽ thu thập mẫu vật và xử lý theo nhu cầu của các nhà nghiên cứu. Một cuộc họp khả thi nên được thiết lập với Quản lý kỹ thuật để thảo luận về các dịch vụ mong muốn.

Để xác nhận việc sử dụng tài nguyên được chia sẻ này, vui lòng đưa nội dung sau vào các ấn phẩm của bạn:

Nghiên cứu này được hỗ trợ một phần bởi Khoản tài trợ NCI P30CA118100 của Trung tâm Ung thư Toàn diện UNM và sử dụng Nguồn tài nguyên chung Phân tích mô và Kho lưu trữ mô người, nhận thêm hỗ trợ từ Khoa Bệnh học của Trường Y khoa Đại học New Mexico.

Liên hệ HTR-TA chia sẻ tài nguyên

Điện thoại: (505) 272-1127
Email: môbank@salud.unm.edu
Phòng Fitz Hall 306B và 306C
Trường Y UNM HSC
Khoa bệnh lý
MSC 08-4640
915 Camino de Salud, ĐB
Albuquerque, NM 87131

Tiêu chuẩn và công nhận kho lưu trữ

Tại nguồn tài nguyên chung UNM HTR-TA, chúng tôi cam kết duy trì các tiêu chuẩn cao nhất trong quản lý mẫu sinh học, đảm bảo chất lượng và giám sát đạo đức. Hoạt động của chúng tôi tuân theo các hướng dẫn nghiêm ngặt và thông lệ tốt nhất do các tổ chức quốc gia và quốc tế hàng đầu thiết lập:

  • Viện Ung thư Quốc gia (NCI) – Chi nhánh Nghiên cứu Mẫu sinh học và Kho lưu trữ sinh học (BBRB)
    Chúng tôi tuân thủ BBRB Thực hành tốt nhất cho nguồn tài nguyên mẫu sinh học, cung cấp hướng dẫn toàn diện về việc thu thập, xử lý, lưu trữ và phân phối mẫu sinh học để đảm bảo tính nhất quán và toàn vẹn khoa học.
    https://biospecimens.cancer.gov/default.asp
  • Hiệp hội quốc tế về kho lưu trữ sinh học và môi trường (ISBER)
    HTR phù hợp với ISBER Thực hành tốt nhất cho kho lưu trữ, một khuôn khổ được công nhận quốc tế về quản lý và quản trị các kho lưu trữ sinh học hỗ trợ nghiên cứu trong khoa học sinh học và môi trường.
    https://www.isber.org/page/BPR
  • Cao đẳng Bệnh học Hoa Kỳ (CAP) – Chương trình công nhận kho lưu trữ sinh học
    HTR tự hào được CAP công nhận thông qua Chương trình công nhận kho lưu trữ sinh học, xác nhận sự tuân thủ của chúng tôi với các tiêu chuẩn hàng đầu trong ngành về chất lượng mẫu sinh học, khả năng truy xuất nguồn gốc và sự xuất sắc trong vận hành.
    https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation/biorepository-accreditation-program

Các tiêu chuẩn này đảm bảo rằng các mẫu sinh học và dịch vụ của chúng tôi hỗ trợ nghiên cứu chất lượng cao, có thể tái tạo và đóng góp có ý nghĩa vào sự tiến bộ trong khoa học ung thư và chăm sóc bệnh nhân.

Nhân sự chia sẻ nguồn lực HTR-TA

joste-nancy-cc.jpgNancy Joste, MD

Giáo sư & Trưởng khoa, Khoa Bệnh lý

Giám đốc Y khoa

Giám sát các khía cạnh kiểm soát chất lượng của Tài nguyên

Cathleen Martinez, Giám đốc điều hànhCathleen Martinez PA

Giám đốc kỹ thuật

Giám sát các khía cạnh kỹ thuật của Tài nguyên

Fred Schultz, MAFred Schultz, MA

Quản lý tin học

Dịch vụ Mô học và Bệnh học Phân tử

Xử lý mô và nhúng parafin và cắt parafin, cũng như đông lạnh nhanh mô và cắt đông lạnh. Nhuộm H&E trên phần paraffin và phần đông lạnh.

Phòng thí nghiệm có thể nhuộm các phần mô bằng các kháng thể tiêu chuẩn bằng cách sử dụng các quy trình đã có sẵn. Ngoài ra, phòng thí nghiệm có thể tạo ra các kháng thể bằng cách sử dụng nền tảng VENTANA DISCOVERY cho phép kết hợp nhiều phương pháp nhuộm để tối ưu hóa kết quả nhuộm.

Hình ảnh HER-2 và ER
Nhuộm kép cho HER-2 và ER
HTR Microarrays mô - e-cadherin

Thiết kế và xây dựng microarray mô: Điều này đòi hỏi phải thu thập các khối parafin của nhà tài trợ, chọn các khu vực quan tâm đến lõi và đặt các lõi vào một khối parafin của người nhận trống. Ưu điểm là về tốc độ và chi phí, vì nhiều mẫu có thể được đánh giá trên một slide. TMA điển hình chứa khoảng 50 đến 200 lõi có đường kính 0.6 mm-2.0 mm. Khoảng 50 phần có thể được lấy từ một khối TMA.

 

(Ở bên phải: E-cadherin)

Nhân viên chia sẻ nguồn lực HTR-TA có thể lấy các khối mô lưu trữ từ Bệnh viện UNM.

Điều này thường bao gồm việc thu thập các mô thừa hoặc mô còn sót lại tại thời điểm cắt bỏ phẫu thuật sau khi các mẫu chẩn đoán đã được lấy để bác sĩ giải phẫu bệnh học xem xét dưới kính hiển vi và đủ mẫu được giữ lại trong parafin để có thể xét nghiệm trong tương lai cho việc chăm sóc bệnh nhân. Nhân viên nguồn lực chung của HTR-TA sẽ thu thập các mô tại Phòng mổ lớn của Khoa phẫu thuật bệnh học UNM HSC. Hiện tại, nguồn lực chung của HTR-TA không thực hiện chọc tĩnh mạch nhưng sẽ lưu trữ các mẫu như vậy theo yêu cầu của các nhà nghiên cứu.

 Các cố vấn dự án tài nguyên chung HTR-TA có thể thu thập dữ liệu bệnh lý và lâm sàng không có mã định danh HIPAA trong khi được mã hóa thành các mẫu phù hợp.

Phân tích hình ảnh

Hình ảnh của H&E hoặc các phần mô nhuộm hóa mô miễn dịch được chụp trên máy quét kỹ thuật số Leica AT2 và tải lên phần mềm chú thích và hình ảnh HALO.

Phần mềm HALO cho phép bạn chú thích mô (khối u, mô đệm, cơ, mỡ, v.v.) và sau đó đếm các tế bào dương tính với protein được lựa chọn (Hình, bên phải) trong mỗi vùng được chú thích này. Nó cũng sẽ cho phép bạn phân tích và định lượng các tương tác hàng xóm gần nhất.

Phần mềm bao gồm một công cụ tạo hình có thể tạo ra các bức ảnh đa bảng của hình ảnh ở các định dạng có thể xuất bản bao gồm khung tham chiếu và thanh tỷ lệ

Hình ảnh kết quả định lượng

Hình này cho thấy định lượng nhuộm Ki67 trong ung thư vú. Bảng trên cùng bên trái hiển thị mẫu microarray mô, bảng giữa hiển thị màu nhuộm Ki67 (màu nâu) không có đánh dấu HALO và bảng bên phải hiển thị hình ảnh tương tự với đánh dấu HALO.

Đánh dấu cho thấy khả năng nhuộm màu ở mức độ thấp (màu vàng), mức độ nhuộm màu vừa phải (màu nâu) và mức độ cao (màu đỏ) của Ki67 trong nhân tế bào khối u. Nhuộm màu xanh lam là các tế bào âm tính với Ki67. Phần mềm có thể đếm độc lập việc nhuộm Ki67 trong lỗ thoát của khối u.

Bảng hiển thị số lượng và tỷ lệ phần trăm ô trong mỗi loại nhuộm màu và biểu đồ cho thấy sự phân bố của màu nhuộm.

Làm thế nào để xin mẫu vật

Liên lạc Cathy Martinez lên lịch.

Mở tài khoản của bạn trong iLab:

  1. Điều hướng đến trang đăng nhập iLabs.
  2. Ở góc trên bên phải của màn hình, hãy chọn đăng ký
  3. Hoàn thành mẫu đăng ký trên trang đăng ký.
  4. Nhận email chào mừng từ iLab với thông tin đăng nhập và hướng dẫn

Yêu cầu Dịch vụ trong iLab:

  1. Thiết lập Yêu cầu Mua hàng (PR) thông qua bộ phận của bạn. Gửi bài PR tới Palakshi Reddy Bandapalli yêu cầu nó được thêm vào trong phòng thí nghiệm của bạn trong hệ thống iLab.
  2. Tới đăng nhập iLabs .
  3. Ở góc trên bên phải của trang này, hãy nhập tên người dùng và mật khẩu của bạn.
  4. Trong tab “Yêu cầu dịch vụ”, nhấp vào “Khởi tạo yêu cầu”.
  5. Hãy hoàn thành biểu mẫu và cung cấp thông tin thanh toán cho yêu cầu của bạn trước khi gửi yêu cầu đến nguồn tài nguyên chung HTR-TA.
    1. Đảm bảo Tên dự án và số SRC/HRRC/IACUC phải khớp với thông tin trên thư chấp thuận.
    2. Trong mỗi danh mục dịch vụ, hãy nhập số lượng mong muốn và nhấp vào tab “Thêm dịch vụ đã chọn”. Các dịch vụ sẽ được thêm vào cuối biểu mẫu.
    3. Sử dụng hộp “Thông tin bổ sung” để thêm bất kỳ chi tiết quan trọng nào và đính kèm / tải lên bất kỳ tài liệu liên quan nào, chẳng hạn như danh sách mẫu vật hoặc mô tả hướng.
  6. Các yêu cầu sẽ chờ xem xét bởi nguồn lực chung HTR-TA, nguồn lực này sẽ thực hiện bất kỳ thay đổi cần thiết nào và gửi lại để bạn chấp thuận. Bạn sẽ nhận được email từ iLab về yêu cầu dự án đã cập nhật của bạn.
Để sử dụng các mẫu vật đã lưu trữ trước đó:
  1. Gửi đề xuất của bạn tới Ủy ban đánh giá khoa học (SRC). Liên hệ Ernestine Armijo để được hướng dẫn trong quá trình này.
  2. Hoàn thành Đơn xin SRC (HRP-224), kèm theo tất cả chữ ký cần thiết và nộp cho SRC.
  3. Sau khi SRC chấp thuận đề xuất của bạn, hãy gửi thư chấp thuận kèm theo đơn đăng ký của bạn tới UNM Ủy ban Đánh giá Nghiên cứu Con người (HRRC) Ban Đánh giá Thể chế (IRB).

Để điều hướng quy trình đăng ký IRB:

  1. Ở liên kết trên, nhấp vào nút “irb.health.unm.edu” ở cuối trang.
  2. Nhấp vào tab IRB ở đầu màn hình
  3. Nhấp vào nút “Tạo nghiên cứu mới” ở bên trái
  4. Điền vào mẫu
  5. Ở câu hỏi số 7, hãy nhấp vào liên kết "Thư viện IRB" và chọn giao thức phù hợp cho nghiên cứu của bạn.
    1. Nếu nghiên cứu của bạn chỉ yêu cầu vật liệu được ẩn danh, hãy chọn Giao thức Loại 4 Miễn trừ (HRP-582). *Lưu ý: Các mô bỏ đi được ẩn danh có thể không cần sự đồng ý.
    2. Nếu nghiên cứu của bạn không yêu cầu thu thập bất kỳ thông tin nào về các cá thể sống, hãy chọn Nghiên cứu Đối tượng Không phải Con người (HRP-585)
    3. Bạn có thể nộp hồ sơ nhanh nếu nghiên cứu của bạn chỉ liên quan đến các mẫu vật được thu thập chỉ cho các mục đích phi nghiên cứu (chẳng hạn như điều trị và chẩn đoán y tế)
  6. Nếu bạn cần trợ giúp trong quá trình nộp đơn IRB hoặc trợ giúp xác định giao thức nào đáp ứng tốt nhất nhu cầu dự án của bạn, vui lòng liên hệ Ernestine Armijo để được hỗ trợ.

Sau khi HRRC phê duyệt, hãy gửi yêu cầu mô đến nguồn tài nguyên chung HTR-TA thông qua iLab. Bạn sẽ được yêu cầu tải lên thư phê duyệt SRC và IRB, và bạn sẽ cần gửi Yêu cầu Mua hàng (PR) đang hoạt động.

Điều hướng iLab:

  1. Hướng đến https://my.ilabsolutions.com/service_center/show_external/3041.
  2. Ở góc trên bên phải của màn hình, chọn Đăng ký.
  3. Hoàn thành mẫu đăng ký.
  4. Nhận email chào mừng từ iLab kèm thông tin đăng nhập và hướng dẫn.

Yêu cầu dịch vụ trong iLab:

  1. Gửi Yêu cầu mua hàng (PR) tới Palakshi Bandapalli yêu cầu thêm nó vào tài khoản iLab của bạn để sử dụng trên các dịch vụ HTR.
  2. Đến phần https://my.ilabsolutions.com/service_center/show_external/3041.
  3. Ở góc trên bên phải của trang, nhấp vào “Đăng nhập” và nhập tên người dùng và mật khẩu.
  4. Trong tab “Yêu cầu dịch vụ”, hãy nhấp vào “bắt đầu yêu cầu” bên cạnh Yêu cầu dịch vụ chia sẻ tài nguyên về Kho lưu trữ mô người và Phân tích mô.
  5. Điền đầy đủ thông tin vào mẫu đơn, bao gồm việc tải lên thư chấp thuận của SRC/IRB/IACUC phù hợp và chọn Số PR từ menu thả xuống. Nhấp vào "Gửi yêu cầu".
  6. Trạng thái yêu cầu sẽ được HTR xem xét. Những thay đổi cần thiết sẽ được thực hiện và gửi lại để phê duyệt.
  7. Email từ iLab sẽ chuyển tiếp trạng thái của dự án.
  1. Liên hệ với nguồn tài nguyên chung HTR-TA để tham gia phiên họp lập kế hoạch/khả thi.
  2. Gửi đề xuất của bạn tới Ủy ban đánh giá khoa học (SRC). Liên hệ Ernestine Armijo để được hướng dẫn về quy trình này.
  3. Sau khi SRC đã phê duyệt đề xuất của bạn, hãy gửi thư chấp thuận cùng với đơn đăng ký của bạn tới Ủy ban Đánh giá Thể chế (IRB) của Ủy ban Đánh giá Nghiên cứu Con người (HRRC) của UNM (xem hướng dẫn ở trên).
  4. Liên hệ với nguồn lực chung HTR-TA để có buổi họp lập kế hoạch bổ sung (thường là bắt buộc để làm rõ chi tiết về quy trình. Cuộc họp này bao gồm việc xin phép Trưởng khoa Phẫu thuật Bệnh lý để đảm bảo có sẵn mẫu vật trong khi vẫn tuân thủ các quy định của phòng xét nghiệm quốc gia và chăm sóc bệnh nhân tốt nhất.
  5. Nếu bạn vẫn còn mô sau khi kết thúc quá trình điều tra, bạn phải trả lại mô cho nguồn tài nguyên chung HTR-TA.
  1. Bạn phải được sự chấp thuận của Ủy ban Đánh giá Nghiên cứu Con người tại địa phương nếu bất kỳ phần nào của mô thu thập được có thể được sử dụng cho nghiên cứu.
  2. Trưởng Bộ phận Bệnh lý Phẫu thuật hoặc người được chỉ định của họ phải phê duyệt phương pháp thu thập mẫu để đảm bảo rằng có đủ mô đại diện được giữ lại để chăm sóc lâm sàng

Hàng tồn kho

Trang web của mô được thu thập

(Bao gồm mô lưu trữ từ UNM và bộ sưu tập tiềm năng cho các nhà điều tra cho các nghiên cứu cụ thể.)

  • Bàng quang, Máu, Xương, Tuỷ xương, Não, Vú
  • Thành ngực, Đại trực tràng
  • Cơ hoành
  • Túi mật
  • Đầu và cổ
  • Thận
  • Gan, phổi, hạch bạch huyết
  • Trung thất
  • Omentum, Buồng trứng
  • Tuyến tụy, Dương vật, Phúc mạc, Tuyến tiền liệt
  • Nước bọt, Tuyến nước bọt, Da, Ruột nhỏ, Mô mềm, Lá lách, Dạ dày
  • Tinh hoàn, tuyến ức, tuyến giáp
  • Tử cung và cổ tử cung
  • Âm đạo / Âm hộ

Liên hệ với chúng tôi để biết giá hiện tại và danh sách cập nhật các kháng thể được tối ưu hóa.

Cơ quan đăng ký ung thư vú mở rộng (EBCR)

Đây là một bộ sưu tập mô phức tạp bao gồm hơn 400 bệnh nhân đồng ý với nhiều mốc thời gian và loại mô được thu thập. Những điều sau đây được thu thập trên mỗi bệnh nhân:

  • 5 chỉ số huyết thanh tối đa / người tham gia / bộ sưu tập (như Baseline hoặc FUP time)
  • 10 phân số huyết tương tối đa / người tham gia / bộ sưu tập
  • 10 mẫu DNA từ máu toàn phần / người tham gia / bộ sưu tập
  • 2 phân số DNA tối đa từ nước súc miệng hoặc tăm bông / người tham gia / bộ sưu tập
  • mô vú (hút kim nhỏ, lọ và khuôn OCT) - tất cả các trường hợp đều khác nhau.

Vui lòng liên hệ với nguồn tài nguyên chung HTR-TA cho truy vấn chi tiết hơn của tập dữ liệu này.